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[protocol] Phenol-chloroform Extraction Introduction A phenol-chloroform extraction is a liquid-liquid extraction. A liquid-liquid extraction is a method that separates mixtures of molecules based on the differential solubilities of the individual molecules in two different immiscible liquids (28). Liquid-liquid extractions are widely used to isolate RNA, DNA, or proteins1. Brief History Volkin & Carter reported the first use of guani.. 공감수 1 댓글수 0 2022. 8. 25.
[Genetics] Definition of genomic nomenclature [Guidelines for Nomenclature 3] Guidelines for Nomenclature of Genes, Genetic Markers, Alleles, and Mutations in Mouse and Rat Revised: September, 2011 6 DefinitionsThe following definitions should aid the user in understanding what is being named, and in understanding the principles underlying these guidelines.6.1 GeneA gene is a functional unit, usually encoding a protein or RNA, whose inherit.. 공감수 2 댓글수 0 2018. 3. 27.
[Genetics] Guidelines for Nomenclature of Mutations in Roden [Guidelines for Nomenclature 2] Guidelines for Nomenclature of Genes, Genetic Markers, Alleles, and Mutations in Mouse and Rat Revised: September, 2011International Committee on Standardized Genetic Nomenclature for MiceChairperson: Dr. Janan T. Eppig (e-mail:janan.eppig@jax.org)Rat Genome and Nomenclature CommitteeChairperson: Dr. Goran Levan (e-mail: Goran.Levan@gen.gu.se) 3 Names and Symbols .. 공감수 1 댓글수 0 2018. 3. 27.
[Genetics] Guidelines for Nomenclature of Genes, Genetic Markers, Alleles [Guidelines for Nomenclature 1] Guidelines for Nomenclature of Genes, Genetic Markers, Alleles 1 Principles of Nomenclature1.1 Key FeaturesThe key component of nomenclature is the gene or locus name and symbol, which identifies a unit of inheritance. Other features, such as alleles, variants and mutations, are secondary to the gene name and become associated with it. Similarly, probes or assays .. 공감수 2 댓글수 0 2018. 3. 27.
[Genetics] Guidelines for Nomenclature of Genes, Genetic Markers, Alleles, and Mutations in Mouse and Rat Guidelines for Nomenclature of Genes, Genetic Markers, Alleles, and Mutations in Mouse and Rat Revised: September, 2011 International Committee on Standardized Genetic Nomenclature for Mice Chairperson: Dr. Janan T. Eppig (e-mail:janan.eppig@jax.org) Rat Genome and Nomenclature Committee Chairperson: Dr. Goran Levan (e-mail: Goran.Levan@gen.gu.se) Rules for mouse genetic nomenclature were first .. 공감수 5 댓글수 3 2014. 7. 30.
FITC and Fluorescein Dyes and Labeling Kits principle of the fluorophore FITC 참고용 자료 FITC and Fluorescein Dyes and Labeling Kits Reactive derivatives of fluorescein dye, including antibody labeling kits 출처http://www.piercenet.com/product/fitc-fluorescein-dyes-labeling-kits Thermo Scientific Fluorescein Labeling Reagents and Kits are high-performance derivatives of fluorescein dye, activated for easy and reliable labeling of antibodies, pr.. 공감수 2 댓글수 0 2014. 6. 5.
[A Short History of Nearly Everything] Small world by Bill Bryson Small World by Bill Bryson * 참고로 Bill Bryson은, 작가의 이름만 보고 책을 골라도 절대 후회하지 않을정도로, 재미있고 위트넘치는 글을 잘 쓰기로 유명한 작가래요^^(그래서인지 글들이 서양식 유머나 언어유희적 표현이 너무 많음…..하… 진짜 하다가 죽는줄 알앗음..ㅜㅜ) (괄호 안 내용들)은 제가 추가적으로 이해를 돕기위해 덧붙이거나 의역한 글입니다. 의역한 부분중 특이한 부분은 영단어도 써 놓았어요. 네가 미생물 같은것들에 너무 많은 개인적인 흥미를 가지게 되는건 아마도 그렇게 좋은 생각은 아닐거야. 프랑스의 위대한 화학자이자 미생물학자인 루이스 파스테르는 그것들(:미생물들. 교수님 교재에는 his라고 되어있는데 이상해서 본문찾아보니까 them-_-)에 굉장히 심취한 상.. 공감수 4 댓글수 0 2012. 6. 17.
8. 형질전환(Transformation) 형질전환(Transformation) 1. 실험배경과 목적 한 세균으로부터 나온 유래한 DNA를 다른 세균이 받아들임으로써 유전형질이 전환되는 유전자 전달방식인데 Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenza, Bacillus subtilis, Streptococcus sanguis, Neisseria gonorrhoeae, Acinetobacter calcoaceticus에서 잘 연구된 바 있으나, 요즈음은 유전자조작 기술의 발달과 더불어 여러 종류의 세균에서 적용되고 있다. 그런데 어떤 세포에서의 형질전환 과정이 자연적인 과정의 하나로 이루어지기 위해서는 유전자 수용세균이 배지내에 있는 DNA를 세포내로 수용할 수 있는 상태(competent)에 있어야 한다. .. 공감수 5 댓글수 0 2012. 6. 9.
7. DNA 전기영동 DNA 전기영동 1. 실험 제목: DNA 전기영동 (DNA Electrophoresis) 2. 실험 목적 등 배경 전기영동(Electrophoresis)이란 특이한 매질 (agarose나 acrylamide)을 이용하여 DNA나 단백질 등의 고분자 물질을 분리하는 방법이다. Agarose에 DNA를 넣고 전기를 걸어주면 DNA는 인산기 때문에 음전하를 띠므로 매질을 타고 양전하 방향으로 움직이게 된다. 이 때 DNA의 움직이는 속도는 DNA의 크기, 형태 (선형, 원형 등)에 따라 다르므로 매질 내에서 그 특성에 따라 분리되어 진다. 본 실험에서는 제한 효소로 자른 plasmid DNA (특별한 구조를 지니지 않은 선형 DNA)와 제한효소를 처리하지 않은 원형 DNA (superhelical 구조를 지님.. 공감수 4 댓글수 0 2012. 6. 9.
6. 제한효소 (restiction enzyme) 반응 제한효소 (restiction enzyme) 반응 1. 실험목적 : DNA를 제한효소로 잘라서 정기영동하여 분석함으로써 제한효소의 특성과 반응을 이해하고 DNA상의 제한효소 지도 (map)를 작성할 수 있는 능력을 기른다. 2. 재료, 실험기구 및 기기 : Plasmid DNA, DNA size marker, 제한효소와 reaction buffer, 3차 증류수, eppendorf tubes, micropipetter (20 ㎕, 200 ㎕), piptet tips, 37℃ water bath, ice bucket, ice, microcentrifuge, microwave, agarose, flask, 미세 저울, ethidium bromide (10 ㎍/ml stock), 6X DNA loading d.. 공감수 3 댓글수 0 2012. 6. 9.
5-2. Plasmid DNA의 분리 및 정제방법 Plasmid DNA의 분리 및 정제방법 플라스미드를 정제는 total cell DNA를 일반적인 분리방법과 같다. 플라스미드를 지니는 세포를 액체배지에서 배양하여 수확하고 cell extract를 하면된다. extract는 단백질을 제거하고 에탄올침전으로 DNA를 응축시킬 수 있다. 그러나 totall cell DNA 분리와 plasmid 정제와는 중요한 차이점이 있다. 플라스미드 분리는 일반적으로 많은 양의 chromosomal DNA 로부터 분리하여야 한다. 플라스미드 분리방법은 플라스미드 DNA와 bacterial DNA의 물리적인 차이점에 의해 분리된다. 가장 큰 플라스미드의 길이는 E. coli 의 염색체 길이에 8%밖에 되지 않으며 대부분이 작다. 플라스미드와 bacteria DNA의 구조에.. 공감수 6 댓글수 0 2012. 6. 9.
5-1. Plasmid Preparation Plasmid Preparation Introduction Alkali lysis method 의 원리 / Solution I, Solution II, Solution III Supercoiled(closed circular) DNA와 open circular DNA DNA precipitation(ethanol) / Biophotometer I. Goal DNA preparation 과정을 구분하여 이해하고 원리를 설명할 수 있다. II. Materials Cell, Solution I, Solution II, Solution III, phenol:chloroform(1:1), 100% ethanol, SDW, ice, LA(LB+Ampicillin) plate, III. Procedure 1. 항생제.. 공감수 3 댓글수 0 2012. 6. 9.
4. E.coli 배양 및 관련 시약 준비 E.coli 배양 및 관련 시약 준비 1.1. A. Plate의 제조 Plate는 박테리아가 자랄 수 있는 최적의 환경이어야 한다. 박테리아는 plate 상에서 자라 colony를 형성하는데, 한 개의 colony는 한 개의 clone으로부터 자란 것이므로 이를 분획하여 여러 실험에 사용할 수 있게 된다. Plate의 조성은 배양시 사용하는 액체 배지(media)의 조성에 agar를 첨가한 것이다. 이때 첨가하는 agar의 농도는 1.5%이며, top agar와 같은 특수한 용도로 사용하기 위해서는 agar의 농도를 변화시키기도 한다. 실험방법 1. Plate를 만들고자 하는 배지를 만든다. 각 배지의 조성은 다음과 같다. 1) LB 배지 (Luria-Bertani medium) 1 liter 1.1.1.. 공감수 5 댓글수 2 2012. 6. 9.
3. 흡광도를 이용한 세균의 성장곡선 측정 흡광도를 이용한 세균의 성장곡선 측정 1. 실험 목적 세균을 액체배지에 배양할 때 성장곡선을 측정하기 위하여 평판배지에서 콜로니숫자를 측정하는 콜로니계수법으로 세균의 숫자를 측정한다. 대량 배양할 때나 실험하는 샘플의 숫자가 많은 경우에는 배양액의 흡광도를 측정함으로써 세균의 생장을 측정할 수 있다. 이번 실험에서는 배양액에서 세균의 생장곡선을 흡광도 측정방법으로 조사한다. 2. 실험 원리 이 방법은 세균의 배양액에 일정한 파장의 빛을 통과시켰을 때 용액은 그 빛을 흡수 또는 산란시킬 수 있고 이 때 흡수된 빛의 양은 용액의 세포농도에 비례함을 이용한 것이다. 은 흡광도계에서의 빛의 경로를 표시한 것이다. 전구에서 나온 백색광은 회절격자(Diffraction grating)에 의해서 일정한 파장 순서의 .. 공감수 7 댓글수 0 2012. 6. 9.
2. 세균 수 측정(Bacterial Population Count) _정량평판법 세균 수 측정(Bacterial Population Count) 1. 실험의 배경과 목적 일정한 체적의 물질 내에 세균이 얼마나 오염되어 있는가를 알아보는 방법에는 여러 가지가 있다. 예컨대 우유에 오염된 세균수를 알아보려면 일정량의 우유를 슬라이드에 도말하여 현미경으로 직접 세어보거나, 혈구 계산에 흔히 쓰이는 혈구계수기(hemacytometer)로써 세균수를 세어 전체 용적의 세균수를 계산하는 방법도 있다. 그러나 위와 같은 방법은 표본에 세균수가 비교적 적은 경우에 적용하는 방법들인 것이다. 본 실험에서는 폐수, 우유, 식료품 등 어떠한 물질이든 간에 세균수 측정에 흔히 사용하는 두가지 방법에 대하여 자세히 알아 보기로 하자. 2. 실험재료 및 방법 1) 정량 평판법(Quantitative plat.. 공감수 6 댓글수 0 2012. 6. 9.
1. 미생물 배지의 준비 미생물 배지의 준비 1. 실험 배경과 목적 세균배양에 필요한 배지는 배양하고자하는 미생물의 종류에 따라 적합한 것을 선택하여 사용하여야 한다. 따라서 미생물의 종류에 따라 배지의 제법이 다소 달라질 수 있다. 여기서는 배지를 준비할 때 기본적인 주의점과 멸균법 및 평판배지, 사면배지 준비법을 살펴보고, 세균배양에 가장 많이 쓰이는 영양배지의 제법을 실습하도록 한다. 1) 배양배지의 준비 배지를 만들 때는 그 조성에 따라 필요한 내용물을 저울 등으로 담아 용기에 담고 혼합하여 물을 가한 후 멸균하는데, 세균배양에 필요한 다양한 배지들이 조성대로 이미 만들어져 탈수시킨 상태(dehydracted media)로 시판되는 종류도 많다. 탈수배지는 정해진 농도로 물을 가한 후, 멸균하여 사용하면 된다. 일반적으로.. 공감수 5 댓글수 0 2012. 6. 9.
LB / LA media, 그리고 LB / LA plate 배지 만들기 배지 만드는 법 오늘은 LB media 와 LA media, 그리고 LB plate와 LA plate를 만들어 보았습니다. LB media 와 LA media는 액체 배지, 그리고 LB plate와 LA plate는 고체배지인데요 이 둘의 차이는 고형화 물질의 유무입니다. 대체로, 고형화를 위해서는 Agar를 사용합니다. 파우더 형태의 시약을 사용할때는 전자저울로 필요한 양을 측정하여 사용합니다. 이때, 시약을 올려놓을 종이를 올려 놓은후, 꼭 영점조절을 해 줍니다. 종이의 무게는 0.26g이네요 0점 조절 버튼을 누르면 무게가 0에서 시작해 순수한 시약의 무게만 측정 할 수가 있게 되죠^.^ LB배지와 LA배지의 차이는 Amp가 들어갔느냐 아니냐의 차이입니다. 엠피실린이 들어가면 LA배지가 됩니다. 엠.. 공감수 11 댓글수 0 2012. 3. 24.
[Organic Chem.] 4th Ed. Solution 유기화학 4판 솔루션입니다 공감수 6 댓글수 0 2012. 3. 24.

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